Sample ID: | 293 |
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Anatomical region: | abdominal cavity |
Organ system: | alimentary system |
Term: | pancreas |
Sub-term: | pancreas left lobe |
Sampling: | 2017-02-16 / provided by Lohi lab |
Transport media: | RNAlater |
Additional info: | Dissection date 16.2.2017 |
From subject: | SLK1048 |
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Breed (variant): | Finnish Lapphund |
Sex: | Female |
Age: | 6y 6m |
Steril./Castr.: | Yes |
Reports: | Necropsy report Clinical test results |
WGS ID: | SLK1048A1, BioProject PRJNA907518, SRR22520749 |
Additional info: | — |
Study: | Study of gene expression across dog tissues |
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Description: | This project will generate the critical resources to better utilize various canine models to advance both dog and human health. |
Status / Visibility: | Submitted / Public |
Publication: | The DoGA consortium expression atlas of promoters and genes in 100 canine tissues. Nat. Commun. 2024, 15(1):9082 (PMID: 39433728) |
Other IDs: | PRJNA907518 |
Additional info: | — |
RNA extraction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ID | Date | Bioanalizer ID | Stock Conc. (ng/µl) |
Tissue ammount | Sample volume | RNA amount (ng) |
Extraction method | RIN | Ratio A260/A280 |
Ratio A260/A230 |
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
38 | 2017-02-27 | 1 (28.2.2017) | 3360.0 (QUBIT) | 15 mg | 40 | 168400.0 | QIAGEN RNeasy Mini Kit | 8.20 | 2.153 | 2.188 | — | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Applied assays
STRT2-seq
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RNA extraction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ID | Date | Bioanalizer ID | Stock Conc. (ng/µl) |
Tissue ammount | Sample volume | RNA amount (ng) |
Extraction method | RIN | Ratio A260/A280 |
Ratio A260/A230 |
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
61 | — | — | 2200 (QUBIT) | 13 mg | 40 | 8800 | Not specified | 6.70 | 2.088 | 1.921 | — | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Applied assays
STRT2-seq
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